Добрый день.
Цитата: Если ООО Б оплатила кредит за другое ООО А . Как можно сделать взаимозачет?
Взаимозачёт - это зачёт
взаимных задолженностей. Пока у вас только задолженность ООО А перед ООО Б.
Цитата: Может ли ООО А (должник ) выполнить какие-нибудь услуги фирме ООО Б в счет погашения этого займа?
Может. Но тогда ООО А, которая, насколько я помню, на ОСНО, нужно было уплатить НДС с полученного аванса в момент перевода средств третьему лицу в счёт предстоящего оказания услуг.
Цитата: Возникает же я верно понимаю договор займа между этими ООО, после того как ООО Б оплатит банку кредит?
Договоры не "возникают".
Я вам в вашей предыдущей теме предлагала определиться "на берегу". И оформить либо договор займа, либо договор поставки (оказания услуг). То есть сначала договориться об условиях, потом - переводить деньги.